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CUT和Tag: 新型蛋白質(zhì)-DNA互作研究工具

更新時(shí)間:2024-06-14

閱讀:161

表觀(guān)遺傳學(xué)研究中,在分子層面研究蛋白質(zhì)與DNA之間的相互作用有助于我們更深入的理解特定細胞功能和疾病發(fā)病機制。CST為了幫助科研人員更快的獲得可靠的實(shí)驗結果,進(jìn)一步擴大了蛋白質(zhì)-DNA互作研究產(chǎn)品組合,重磅推出了完整的CUT&Tag(Cleavage Under Targets and Tagmentation)解決方案,包括CUT&Tag試劑盒(#77552)、 建庫試劑盒(#47415)、抗體和適用于細胞以及組織的實(shí)驗步驟說(shuō)明書(shū)。

 

CUT&Tag實(shí)驗步驟

對于CST CUT&Tag實(shí)驗,首先將細胞與刀豆蛋白A包被的磁珠混合。洋地黃皂苷的透化處理可以讓靶標特異性的一抗進(jìn)入細胞并結合目的蛋白。由于需要將信號放大,因此還要添加二抗。隨后進(jìn)行預裝接頭的高活性CUT&Tag pAG-Tn5 (Loaded) (#79561)融合轉座酶的孵育,轉座酶進(jìn)入細胞后可以通過(guò)pAG結構域與二抗結合,這樣就使轉座酶與靶標蛋白間接聯(lián)系起來(lái)。加入Mg2+激活轉座酶活性后,目標基因組 DNA 會(huì )被切割并就地連接接頭 DNA,最后進(jìn)行DNA純化和PCR擴增。由于省去了體外接頭連接步驟,CUT&Tag可以節省您寶貴的時(shí)間,讓您在更短的時(shí)間內進(jìn)行蛋白質(zhì)-DNA相互作用研究。

 

圖1:CUT&Tag 實(shí)驗原理

CUT&Tag為何與眾不同?

雖然ChIP仍然是研究蛋白質(zhì)-DNA相互作用的主要方法,但隨著(zhù)新的研究工具的出現,例如CUT&RUN以及CUT&Tag,傳統ChIP-Seq實(shí)驗需要大量樣品,重復性差、高背景等問(wèn)題得到了解決。CST CUT&Tag試劑盒(#77552)經(jīng)過(guò)了嚴格驗證,適用于細胞和組織樣品中多種靶標類(lèi)型,并包含了陽(yáng)性對照抗體Tri-Mmethyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751和陰性對照抗體Normal Rabbit IgG #2729 / Normal Mouse IgG #68860,以及抗兔和抗鼠的二抗。同時(shí),當樣品量不足時(shí),該試劑盒還可以幫助您更快獲得實(shí)驗結果,節省測序成本,并使單細胞染色質(zhì)分析成為可能。

 

圖2:CUT&Tag優(yōu)勢

此外,CST還專(zhuān)門(mén)針對CUT&Tag驗證了多種一抗,包括組蛋白靶標和部分非組蛋白靶標,以確保實(shí)驗結果的可重復性和可靠性。

CUT&Tag 試劑為您提供高質(zhì)量數據

一、組蛋白修飾分析

1、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751對HCT 116細胞進(jìn)行CUT&Tag實(shí)驗。
 


2、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751對低細胞數量的NCCIT細胞進(jìn)行CUT&Tag實(shí)驗。

 

 

二、轉錄因子和輔因子分析

1、使用Nanog (D2A3) XP Rabbit mAb (Mouse Specific) #8822對F9細胞進(jìn)行CUT&Tag實(shí)驗。

 

 

2、使用  JARID2  (D6M9X)  Rabbit  mAb  #13594  對NCCIT細胞進(jìn)行CUT&Tag實(shí)驗。

 

 

3、使用ATF-4 (D4B8) Rabbit mAb #11815對低細胞數量的Hep G2細胞進(jìn)行CUT&Tag實(shí)驗。

 

 

三、組織樣品分析
1、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751對小鼠腦組織進(jìn)行CUT&Tag實(shí)驗。

 

 

2、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751對小鼠肝組織進(jìn)行CUT&Tag實(shí)驗。

 

 

3、使用Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb #9751對小鼠心臟組織進(jìn)行CUT&Tag實(shí)驗。

 

 

CST經(jīng)過(guò)嚴格驗證的一站式CUT&Tag解決方案現已全面上線(xiàn):CUT&Tag試劑盒(#77552) + 一抗和二抗 + 建庫試劑盒(#47415)

CUT&Tag試劑盒和試劑

貨號產(chǎn)品名稱(chēng)規格
77552CUT&Tag Assay Kit1 kit
79561CUT&Tag pAG-Tn5 (Loaded)100ul
47415CUT&Tag Dual Index Primers and PCR Master Mix for Illumina Systems1 kit
63228CUT&Tag PCR Master Mix840ul

 

部分CUT&Tag驗證抗體列表

貨號品名
8173Acetyl-Histone H3 (Lys27) (D5E4) Xpe Rabbit mAb
9649Acetyl-Histone H3 (Lys9) (C5B11) Rabbit mAb
52885Anti-mouse secondary Ab
35401Anti-rabbit secondary Ab
11815ATF-4 (D4B8) Rabbit mAb
6964Bmi1 (D20B7) Xe Rabbit mAb
5856Bmi1 (D42B3) Rabbit mAb
25069CBX2 (EЗN6A) Rabbit mAb
14696CBX8 (D208C) Rabbit mAb
3418CTCF (D31H2) Xpe Rabbit mAb
9725Di-Methyl-Histone H3 (Lys4)(C64G9) Rabbit mAb
4658Di-Methyl-Histone H3 (Lys9) (D85B4) Xp® Rabbit mAb
32578DNMT3A(D2H4B) Rabbit mAb
57868DNMTЗB (E8A8A) xpe Rabbit mAb
85322EED (E4L6E) XP® Rabbit mAb
5246Ezh2 (D2C9) XP3 Rabbit mAb
5851GATA-6 (D61E4) Xp® Rabbit mAb
42427Helios (D8W4X) XP3 Rabbit mAb
13594JARID2 (D6M9X) Rabbit mAb
97800MITF (D3B4T)Rabbit mAb
14689MLL1 (D2M7U) Rabbit mAb (Amino-terminal Antigen)
14111Mono-Methyl-Histone H3 (Lys36) (D9J1D) Rabbit mAb
5326Mono-MethylHistone H3 (Lys4) (D1A9) Xp® Rabbit mAb
5232Nanog (D73G4} XP® Rabbit mAb (ChiP Formulated)
68860Normal Mouse lgG
13499Phospho-Rpb1 cTD (Ser2) (E1Z3G) Rabbit mAb
13546Phospho-Rpb1 cTD (ser2/ser5) (D1G3K) Rabbit mAb
2729Rabbit lgG
2629Rpb1 CTD (4H8) Mouse mAb
11956SMARCC1/BAF155 (D7F8S) Rabbit mAb
2569TCF4/TCF7L2 (C48H11) Rabbit mAb
9733Tri-Methyl-Histone H3 (Lys27) (C36B11) Rabbit mAb
9751Tri-Methyl-Histone H3 (Lys4) (C42D8) Rabbit mAb
5737Tri-Methyl-Histone H4 (Lys20)(D84D2) Rabbit mAb
8240ubiquityi-Histone H2A (Lys119} (D27C4) Xpe Rabbit mAb

 

部分相關(guān)產(chǎn)品

貨號產(chǎn)品應用
56383SSimpleChIP® Plus Sonication Chromatin IP Kit超聲法,磁珠,可應用于ChIP,ChIP-seq
9005SSimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads) 酶解法,磁珠,可應用于ChIP,ChIP-seq
9004SSimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Agarose Beads)酶解法,瓊脂糖珠,可應用于ChIP
9003SSimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic Beads)酶解法,磁珠,可應用于ChIP,ChIP-seq
9002SSimpleChIP® Enzymatic Chromatin IP Kit (Agarose Beads)酶解法,瓊脂糖珠,可應用于ChIP
abs50034染色質(zhì)免疫共沉淀(ChIP)試劑盒蛋白 A/G 磁珠,超聲法,,可應用于ChIP,ChIP-seq
86652CUT&RUN Assay KitCUT&RUN
40366CUT&RUN pAG-MNase and Spike-In DNACUT&RUN
48105CUT&RUN 4X Stop BufferCUT&RUN
42015CUT&RUN DNA Extraction BufferCUT&RUN
15338Antibody Binding Buffer (CUT&RUN, CUT&Tag)CUT&RUN, CUT&Tag
3141510X Wash Buffer (CUT&RUN, CUT&Tag)CUT&RUN, CUT&Tag
14209DNA Purification Buffers and Spin Columns (ChIP, CUT&RUN, CUT&Tag)ChIP, CUT&RUN, CUT&Tag

 

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